首都儿科研究所已有40余年的发展历史。研究所以研究小儿感染性疾病和群体儿童保健为重点，在细胞学、病毒学、临床诊断治疗学等方面建立了基础研究与临床应用紧密结合的完整体系，承担了一系列关系到儿童常见病、人口健康的重大科研项目，在一些应用性基础研究学科中发挥着技术核心作用。所内建有世界卫生组织儿童卫生合作中心、中国儿童卫生保健疾病防治指导中心、中-加儿童健康研究合作中心、北京市感染与免疫中心实验室。作为国务院学位委员会批准的儿科硕士、儿科博士学位授权单位，80年代以来独立培养了160余名博士、硕士研究生，有6名中青年科技骨干入选北京市科技新星。50余名留学人员学成归国，为研究所的发展注入了新的活力，研究所现已成为高水平儿科研究人才培养基地。“九五”期间研究所新开国家级、国际合作类、部、市级以上课题66项，争取项目经费2000余万元，并有一批优秀研究项目获得了国家级、北京市、卫生部各类科技进步奖。研究所始终保持着与国际同行研究机构之间、著名的学术带头人之间的学术交往与联系，并注重引进发达国家中儿童医疗卫生机构的最新实验诊断与治疗技术，为儿科事业的发展起到了积极的促进作用。2001年研究所当选为北京市属科研院所联谊会理事长单位。

　　 附属儿童医院是三级甲等医院、爱婴医院、北京大学教学医院、北京高等医学专科学校教学医院、规范化服务达标医院。医院编制床位300张，设有内科、外科、急诊科、保健科、耳鼻喉科、口腔科、眼科、中医科、皮肤科等临床科室，并根据儿童发病特点开设了呼吸、神经、心血管、新生儿、血液、消化内科，新生儿外科、普外、泌尿外科，生长发育、营养、智力测查等20多个专业，及哮喘、血管瘤等6个专病门诊。为满足不同消费层次的需求，医院还建有特需门诊、A级病房及计算机远程医疗咨询会诊中心。医院拥有CT、彩超、动态心电、脑电图系统、诱发电位、自动生化分析仪等多种先进的检查、诊断设备。专家门诊应诊专家80余人，其中特级专家12人。医院平均年门诊量70余万人次，年住院病人6000人次。2002年初，附属儿童医院11000平方米的新门诊大楼落成。新门诊楼的建设颇具现代儿童医院特点，突出“以人为本”的新理念，为小患者营造了温馨、舒适、便利的就诊环境和就医条件。